2002年日本發生多宗奇怪的人口失蹤案，記者城戶真司為了調查此事，便到其中一個受害者神原耕一的家中調查，期間他發現了一個卡片盒，后來真司意外地使用卡片盒的力量變身為假面騎士龍騎，并認識了另一騎士秋山蓮和神崎士郎的妹妹神崎優衣。 真司成為騎士的目的是保護人類和阻止騎士之間的戰斗；相反不喜歡戰斗的蓮為了救愛人，而被迫與其他騎士戰斗。隨著其他騎士的出現 ，騎士的戰斗漸漸變得激烈，即使真司拼命阻止，但戰斗的犧牲者仍在陸續出現。